美國的漁業(yè)管理機構(gòu)分聯(lián)邦、州和地方政府三級：其中聯(lián)邦政府負責(zé)全國性及州際食品安全事務(wù)，涉及到農(nóng)業(yè)部、商務(wù)部、衛(wèi)生與人類服務(wù)部、環(huán)境保護局等有關(guān)部署的下署具體管理部門，如食品與藥品管理局、食品安全檢驗局、國家海洋漁業(yè)管理局和水資源辦公室等部門；州政府主要負責(zé)本州內(nèi)部的食品安全，涉及衛(wèi)生保健廳、環(huán)境保護廳、農(nóng)業(yè)廳、資源和野生動物保護廳等部門；地方政府主要是市政當(dāng)局，承擔(dān)本轄區(qū)的監(jiān)管責(zé)任。
美國衛(wèi)生與人類服務(wù)部（DHHS）下屬的食品藥品監(jiān)督管理局（FDA）是美國聯(lián)邦政府主管食品與藥品的最高行政管理機構(gòu)，它的使命是通過《聯(lián)邦食品、藥品和化妝品法》（FD&C Act）和其他公眾健康法律來保護消費者健康。美國80%的食品都由FDA監(jiān)管，監(jiān)管食物類別為膳食補充劑、瓶裝水、食品添加劑、嬰兒配方奶粉、其他食品（不包含肉、禽和蛋制品），水產(chǎn)品也是由FDA進行監(jiān)管的。FDA在水產(chǎn)品監(jiān)管中主要負責(zé)水產(chǎn)品質(zhì)量及其標(biāo)準(zhǔn)的制定與執(zhí)行，并且主要對水產(chǎn)品進出口的程序以及進出口水產(chǎn)品的質(zhì)量進行監(jiān)管。FDA管轄的魚類和貝類主要指牡蠣、大馬哈魚、蝦和金槍魚這幾類水產(chǎn)品，規(guī)定了包括定義、可選用的原料種類、生產(chǎn)工藝、產(chǎn)品規(guī)格、瀝干物測定方法、抽樣和驗收步驟、標(biāo)簽等方面的要求（21CFR161）。
美國農(nóng)業(yè)部（USDA）主要負責(zé)對鮰魚的監(jiān)管，與FDA和州立機構(gòu)共同負責(zé)貝類衛(wèi)生計劃的實施。
美國商業(yè)部（YSDC）下屬的國家海洋與大氣管理局（NOAA）與FDA簽署了諒解備忘錄，開展聯(lián)合水產(chǎn)品檢查計劃。NOAA根據(jù)《水產(chǎn)品檢查計劃》（Seafood Inspection Program），通過收費服務(wù)(fee- for–service)的方式，對加工漁船和水產(chǎn)品加工廠提供檢查檢測服務(wù)。
