中國(guó)涉及水產(chǎn)品的監(jiān)管機(jī)構(gòu)主要涉及農(nóng)業(yè)部、國(guó)家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)、國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局和國(guó)家質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)檢疫總局。此外，還有全國(guó)水產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)（TC I56）負(fù)責(zé)全國(guó)水產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)化工作
農(nóng)業(yè)部主要負(fù)責(zé)鮮活等初級(jí)水產(chǎn)品的水產(chǎn)品質(zhì)量安全管理，主要監(jiān)管環(huán)節(jié)是海洋捕撈、內(nèi)陸及沿海水產(chǎn)品的養(yǎng)殖生產(chǎn)，其中最重要的職責(zé)是漁業(yè)生產(chǎn)和水產(chǎn)品養(yǎng)殖加工的施藥管理和藥殘檢測(cè)。在農(nóng)業(yè)部?jī)?nèi)部，幾乎所有業(yè)務(wù)部門都與水產(chǎn)品質(zhì)量安全工作相關(guān)，包括漁業(yè)局、政策法規(guī)司、市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)體制與經(jīng)營(yíng)管理司、農(nóng)產(chǎn)品加工司、獸醫(yī)局等等，其中最主要的負(fù)責(zé)機(jī)構(gòu)為漁業(yè)局，該局負(fù)責(zé)全國(guó)水產(chǎn)品的養(yǎng)殖、加工、捕撈、漁用船舶、漁港、漁船、水產(chǎn)品流通、遠(yuǎn)洋漁業(yè)和漁業(yè)生態(tài)環(huán)境等行業(yè)生態(tài)管理。此外，農(nóng)業(yè)部還下設(shè)國(guó)家水產(chǎn)品質(zhì)檢中心、漁業(yè)環(huán)境監(jiān)測(cè)中心、中國(guó)水產(chǎn)品質(zhì)量認(rèn)證中心等開展水產(chǎn)品生產(chǎn)監(jiān)測(cè)的輔助性研究工作。
國(guó)家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)是根據(jù)《國(guó)務(wù)院機(jī)構(gòu)改革和職能轉(zhuǎn)變方案》和《國(guó)務(wù)院關(guān)于機(jī)構(gòu)設(shè)置的通知》（國(guó)發(fā)〔2013〕14號(hào)）設(shè)立的，為國(guó)務(wù)院組成部門，負(fù)責(zé)統(tǒng)籌規(guī)劃醫(yī)療衛(wèi)生和計(jì)劃生育服務(wù)資源配置，組織制定國(guó)家基本藥物制度，擬訂計(jì)劃生育政策，監(jiān)督管理公共衛(wèi)生和醫(yī)療服務(wù)，負(fù)責(zé)計(jì)劃生育管理和服務(wù)工作等。其中，涉及水產(chǎn)品的職責(zé)包括：負(fù)責(zé)起草水產(chǎn)品相關(guān)的法律法規(guī)草案，擬定政策規(guī)劃，制定相關(guān)部門規(guī)章、標(biāo)準(zhǔn)和技術(shù)法規(guī)；組織開展食品安全風(fēng)險(xiǎn)監(jiān)測(cè)、評(píng)估，依法制定并公布食品安全標(biāo)準(zhǔn)，負(fù)責(zé)食品、食品添加劑及相關(guān)產(chǎn)品新原料、新品種的安全性審查等。
國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局是國(guó)務(wù)院綜合監(jiān)督管理藥品、醫(yī)療器械、化妝品、保健食品和餐飲環(huán)節(jié)食品安全的直屬機(jī)構(gòu)，負(fù)責(zé)食品、藥品、醫(yī)療器械、化妝品的監(jiān)督管理。其中涉及水產(chǎn)品的職責(zé)主要涉及水產(chǎn)品市場(chǎng)銷售環(huán)節(jié)和水產(chǎn)品加工制品的生產(chǎn)加工、流通、消費(fèi)等各個(gè)環(huán)節(jié)的質(zhì)量安全監(jiān)管。
國(guó)家質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)檢疫總局主管全國(guó)進(jìn)出口水產(chǎn)品檢驗(yàn)檢疫及監(jiān)督管理工作。國(guó)家質(zhì)檢總局設(shè)在各地的出入境檢驗(yàn)檢疫機(jī)構(gòu)（以下簡(jiǎn)稱檢驗(yàn)檢疫機(jī)構(gòu)）負(fù)責(zé)所轄區(qū)域進(jìn)出口水產(chǎn)品檢驗(yàn)檢疫及監(jiān)督管理工作。
除上述監(jiān)管機(jī)構(gòu)之外，負(fù)責(zé)全國(guó)水產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)化工作的是全國(guó)水產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)（TC I56）（http://www.cafs.ac.cn/），其秘書處所在單位為中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院。TC 156下設(shè)8個(gè)分技術(shù)委員會(huì)，分別為TC156/SC1 淡水養(yǎng)殖分技術(shù)委員會(huì)、TC156/SC2 海水養(yǎng)殖分技術(shù)委員會(huì)、 TC156/SC3 水產(chǎn)品加工分技術(shù)委員會(huì)、TC156/SC4 漁具及漁具材料分技術(shù)委員會(huì)、 TC156/SC6 漁業(yè)機(jī)械儀器分技術(shù)委員會(huì)、 TC156/SC8 觀賞魚分技術(shù)委員會(huì)、TC156/SC9 珍珠分技術(shù)委員會(huì)和TC156/SC10 漁業(yè)資源分技術(shù)委員會(huì)。
